Créée en 2001 puis cloturée en 2008 après la création de l'UMR, la structure GIS-FOTON avait pour vocation l’intégration de laboratoires régionaux ayant pour sujets principaux de recherche l’optique pour les télécommunications.
Ce groupement scientifique était composé de quatre laboratoires fondateurs :

• Laboratoire d'Optronique de l'ENSSAT

• Département d'Optique de l'ENST-Bretagne

• Laboratoire d'Etudes des Nanostructures à Semiconducteurs de l'INSA-Rennes (LENS)
  

• Laboratoire de Physique des Lasers du PALMS

et du centre technologique de recherche commun à l'ENSSAT et à l'ENST-Bretagne :

• Centre Commun Lannionnais d'Optique (CCLO)
  

En 2004, ces laboratoires avaient été rejoints par le :

• laboratoire Recherche Electronique Signal Optique de l’ENI-Brest (RESO)